MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020834	GCA	2	6	208242	208247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
3502	NC_020834	TAAAGG	2	12	208280	208291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472335454
3503	NC_020834	TGA	2	6	208304	208309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
3504	NC_020834	AGT	2	6	208310	208315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
3505	NC_020834	GAA	2	6	208331	208336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335454
3506	NC_020834	AAAGT	2	10	208337	208346	60 %	20 %	20 %	0 %	472335454
3507	NC_020834	CGT	2	6	208382	208387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
3508	NC_020834	GA	3	6	208411	208416	50 %	0 %	50 %	0 %	472335455
3509	NC_020834	AGC	3	9	208501	208509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
3510	NC_020834	GCA	2	6	208568	208573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
3511	NC_020834	TGC	2	6	208681	208686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
3512	NC_020834	GGT	2	6	208804	208809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335456
3513	NC_020834	TAT	2	6	208812	208817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335456
3514	NC_020834	AGT	2	6	208836	208841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335456
3515	NC_020834	CAG	2	6	208895	208900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335456
3516	NC_020834	TCG	2	6	208926	208931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335456
3517	NC_020834	ACA	2	6	208968	208973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335456
3518	NC_020834	ATC	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335456
3519	NC_020834	TGG	2	6	209046	209051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335456
3520	NC_020834	TTCT	2	8	209093	209100	0 %	75 %	0 %	25 %	472335456
3521	NC_020834	GTT	2	6	209131	209136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335456
3522	NC_020834	CAA	2	6	209141	209146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335456
3523	NC_020834	TGC	2	6	209184	209189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335456
3524	NC_020834	GAA	2	6	209209	209214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335456
3525	NC_020834	CAG	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335457
3526	NC_020834	ATCA	2	8	209371	209378	50 %	25 %	0 %	25 %	472335457
3527	NC_020834	TGG	2	6	209503	209508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
3528	NC_020834	GGC	2	6	209540	209545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335458
3529	NC_020834	TCG	2	6	209551	209556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
3530	NC_020834	GGT	2	6	209567	209572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
3531	NC_020834	TCG	2	6	209587	209592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
3532	NC_020834	AGC	2	6	209701	209706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335458
3533	NC_020834	CAT	2	6	209710	209715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335458
3534	NC_020834	AGT	2	6	209770	209775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335458
3535	NC_020834	GCT	2	6	209810	209815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
3536	NC_020834	GCT	2	6	209822	209827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
3537	NC_020834	TTGT	2	8	209917	209924	0 %	75 %	25 %	0 %	472335459
3538	NC_020834	TAT	2	6	209990	209995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3539	NC_020834	AATT	2	8	209999	210006	50 %	50 %	0 %	0 %	472335459
3540	NC_020834	ACA	2	6	210009	210014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
3541	NC_020834	CAT	2	6	210024	210029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
3542	NC_020834	TGG	2	6	210051	210056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335459
3543	NC_020834	TAT	2	6	210090	210095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3544	NC_020834	ATT	2	6	210115	210120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3545	NC_020834	ATT	2	6	210126	210131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3546	NC_020834	CACC	2	8	210142	210149	25 %	0 %	0 %	75 %	472335459
3547	NC_020834	AAAG	2	8	210162	210169	75 %	0 %	25 %	0 %	472335459
3548	NC_020834	GTC	2	6	210182	210187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335459
3549	NC_020834	TTA	2	6	210223	210228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3550	NC_020834	TAT	2	6	210302	210307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3551	NC_020834	GTA	2	6	210322	210327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335459
3552	NC_020834	ATT	2	6	210409	210414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3553	NC_020834	TTG	2	6	210425	210430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
3554	NC_020834	TAC	2	6	210500	210505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
3555	NC_020834	AAT	2	6	210513	210518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335459
3556	NC_020834	TGT	2	6	210540	210545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
3557	NC_020834	TTG	2	6	210548	210553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
3558	NC_020834	AGA	2	6	210565	210570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335459
3559	NC_020834	CAA	2	6	210595	210600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
3560	NC_020834	ATG	2	6	210607	210612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335459
3561	NC_020834	TAT	2	6	210687	210692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3562	NC_020834	TGT	2	6	210792	210797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
3563	NC_020834	ATT	2	6	210798	210803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
3564	NC_020834	CTTT	2	8	210827	210834	0 %	75 %	0 %	25 %	472335459
3565	NC_020834	AACA	2	8	210920	210927	75 %	0 %	0 %	25 %	472335459
3566	NC_020834	TA	3	6	210977	210982	50 %	50 %	0 %	0 %	472335459
3567	NC_020834	TGTT	2	8	210990	210997	0 %	75 %	25 %	0 %	472335459
3568	NC_020834	CAT	2	6	211008	211013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
3569	NC_020834	CGT	2	6	211016	211021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335459
3570	NC_020834	GGT	2	6	211045	211050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335459
3571	NC_020834	CAT	2	6	211052	211057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
3572	NC_020834	ATTG	2	8	211059	211066	25 %	50 %	25 %	0 %	472335459
3573	NC_020834	GTT	2	6	211072	211077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
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3575	NC_020834	GAA	2	6	211140	211145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335459
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3577	NC_020834	AC	3	6	211484	211489	50 %	0 %	0 %	50 %	472335461
3578	NC_020834	TGC	2	6	211547	211552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
3579	NC_020834	GAA	2	6	211617	211622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335461
3580	NC_020834	CGT	2	6	211653	211658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
3581	NC_020834	TCG	2	6	211718	211723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335461
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3583	NC_020834	ATAA	2	8	211812	211819	75 %	25 %	0 %	0 %	472335462
3584	NC_020834	A	7	7	211854	211860	100 %	0 %	0 %	0 %	472335462
3585	NC_020834	GGT	2	6	211960	211965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335462
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3587	NC_020834	TGC	2	6	212013	212018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
3588	NC_020834	CAA	2	6	212102	212107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335462
3589	NC_020834	GCA	2	6	212122	212127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335462
3590	NC_020834	GTC	2	6	212180	212185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
3591	NC_020834	A	6	6	212191	212196	100 %	0 %	0 %	0 %	472335462
3592	NC_020834	CGT	2	6	212197	212202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335462
3593	NC_020834	CGT	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335463
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3595	NC_020834	TAT	2	6	212517	212522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335463
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3598	NC_020834	GTA	2	6	212627	212632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335463
3599	NC_020834	TGA	2	6	212659	212664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335463
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3601	NC_020834	A	6	6	212690	212695	100 %	0 %	0 %	0 %	472335463
3602	NC_020834	CAT	2	6	212712	212717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335463
3603	NC_020834	CGT	2	6	212792	212797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335463
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3606	NC_020834	AGTT	2	8	212947	212954	25 %	50 %	25 %	0 %	472335464
3607	NC_020834	CGC	2	6	213023	213028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335464
3608	NC_020834	CAG	2	6	213097	213102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335464
3609	NC_020834	AAG	2	6	213105	213110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335464
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3613	NC_020834	TAAA	2	8	213198	213205	75 %	25 %	0 %	0 %	472335464
3614	NC_020834	CA	3	6	213238	213243	50 %	0 %	0 %	50 %	472335464
3615	NC_020834	TAG	2	6	213408	213413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335464
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3653	NC_020834	A	6	6	215544	215549	100 %	0 %	0 %	0 %	472335466
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3733	NC_020834	TTTG	2	8	219428	219435	0 %	75 %	25 %	0 %	472335470
3734	NC_020834	TTAA	2	8	219446	219453	50 %	50 %	0 %	0 %	472335470
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3987	NC_020834	TGT	2	6	232639	232644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335483
3988	NC_020834	CTT	2	6	232753	232758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335483
3989	NC_020834	ATAA	2	8	232774	232781	75 %	25 %	0 %	0 %	472335483
3990	NC_020834	CCG	2	6	232824	232829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335483
3991	NC_020834	GCC	2	6	232911	232916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335483
3992	NC_020834	GCG	2	6	232952	232957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335483
3993	NC_020834	TGC	2	6	233072	233077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335483
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3996	NC_020834	TCA	2	6	233163	233168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335483
3997	NC_020834	TTC	2	6	233210	233215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335483
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3999	NC_020834	AT	3	6	233353	233358	50 %	50 %	0 %	0 %	472335484
4000	NC_020834	CGGA	2	8	233466	233473	25 %	0 %	50 %	25 %	472335484

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